Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD55Q3KP44 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD55Q3KP44 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms