Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDRF1Q3B7T1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms