Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL40Q2TBA0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms