Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC6LQ2NKX8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms