Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SWI5Q1ZZU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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