Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TXNRD1Q16881 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TXNRD1Q16881 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TXNRD1Q16881 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TXNRD1Q16881 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TXNRD1Q16881 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TXNRD1Q16881 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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TXNRD1Q16881 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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TXNRD1Q16881 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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TXNRD1Q16881 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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TXNRD1Q16881 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TXNRD1Q16881 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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TXNRD1Q16881 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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TXNRD1Q16881 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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TXNRD1Q16881 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TXNRD1Q16881 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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