Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DDB1Q16531 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDB1Q16531 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDB1Q16531 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms