Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPE65Q16518 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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RPE65Q16518 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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RPE65Q16518 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPE65Q16518 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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