Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRA6Q16445 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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GABRA6Q16445 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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GABRA6Q16445 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GABRA6Q16445 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GABRA6Q16445 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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GABRA6Q16445 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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GABRA6Q16445 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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GABRA6Q16445 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABRA6Q16445 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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