Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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SSX2Q16385 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSX2Q16385 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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