Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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