Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRADDQ15628 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRADDQ15628 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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