Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SEC23BQ15437 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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SEC23BQ15437 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SEC23BQ15437 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SEC23BQ15437 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SEC23BQ15437 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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SEC23BQ15437 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SEC23BQ15437 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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