Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RYR3Q15413 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RYR3Q15413 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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