Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SF3B3Q15393 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3B3Q15393 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B3Q15393 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
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