Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKD1Q15139 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKD1Q15139 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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