Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KARSQ15046 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KARSQ15046 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KARSQ15046 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KARSQ15046 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KARSQ15046 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KARSQ15046 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KARSQ15046 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KARSQ15046 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KARSQ15046 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KARSQ15046 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KARSQ15046 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
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