Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAPTM4AQ15012 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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