Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCLAFQ15004 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCLAFQ15004 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms