Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL9A2Q14055 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COL9A2Q14055 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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