Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CNGB1Q14028 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNGB1Q14028 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
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