Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CKAP5Q14008 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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