Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA1SQ13698 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1SQ13698 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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