Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR3Q13615 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR3Q13615 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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