Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
DNASE1L3Q13609 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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DNASE1L3Q13609 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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DNASE1L3Q13609 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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DNASE1L3Q13609 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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DNASE1L3Q13609 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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DNASE1L3Q13609 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DNASE1L3Q13609 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DNASE1L3Q13609 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNASE1L3Q13609 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DNASE1L3Q13609 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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