Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAMK2BQ13554 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAMK2BQ13554 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms