Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKRN4PQ13434 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN4PQ13434 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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