Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX10Q13206 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX10Q13206 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDX10Q13206 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms