Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RESTQ13127 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RESTQ13127 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RESTQ13127 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RESTQ13127 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RESTQ13127 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RESTQ13127 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RESTQ13127 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RESTQ13127 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RESTQ13127 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RESTQ13127 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RESTQ13127 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RESTQ13127 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RESTQ13127 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RESTQ13127 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RESTQ13127 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RESTQ13127 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RESTQ13127 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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