Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPS1Q13098 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPS1Q13098 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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