Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKRN3Q13064 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKRN3Q13064 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKRN3Q13064 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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