Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX4Q12846 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX4Q12846 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX4Q12846 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
STX4Q12846 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
STX4Q12846 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STX4Q12846 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STX4Q12846 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STX4Q12846 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
STX4Q12846 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
STX4Q12846 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
STX4Q12846 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
STX4Q12846 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
STX4Q12846 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
STX4Q12846 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STX4Q12846 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STX4Q12846 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms