Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 GEM1YAL048C 1989 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 ISD11YER048W-A 285 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 AST2YER101C 1293 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 CAB4YGR277C 918 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 CYC3YAL039C 810 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YKL044WYKL044W 321 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YRA2YKL214C 612 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YBL055CYBL055C 1257 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YPL276WYPL276W 438 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YPR039WYPR039W 336 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YPT10YBR264C 600 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 VMS1YDR049W 1899 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 RGD2YFL047W 2145 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 PIG2YIL045W 1617 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 GCR2YNL199C 1605 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 APE1YKL103C 1545 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YGL072CYGL072C 360 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 EFB1YAL003W 621 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 LSM8YJR022W 330 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 ATG10YLL042C 504 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 AFB1YLR040C 675 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 AAR2YBL074C 1068 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 SOL1YNR034W 966 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YOR121CYOR121C 306 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 SUS1YBR111W-A 291 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MCP2YLR253W 1710 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 RTC5YOR118W 1704 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 TOS1YBR162C 1368 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 RGD1YBR260C 2001 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 CDC4YFL009W 2340 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 BRE2YLR015W 1518 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MMT1YMR177W 1533 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 BRE5YNR051C 1548 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YLL058WYLL058W 1728 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MDH3YDL078C 1032 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YER137W-AYER137W-A 306 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 SEC53YFL045C 765 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 RPS25AYGR027C 327 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YIL054WYIL054W 318 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 ACS1YAL054C 2142 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 IMP4YNL075W 873 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 RPL18BYNL301C 561 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 ATP3YBR039W 936 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YPR077CYPR077C 372 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YBR124WYBR124W 360 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 DBP3YGL078C 1572 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MOT2YER068W 1764 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 TLC1TLC1 1301 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 FET4YMR319C 1659 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 RIO1YOR119C 1455 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 RPL39YJL189W 156 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 OCT1YKL134C 2319 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 BIO3YNR058W 1443 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 GAT2YMR136W 1683 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YER076CYER076C 909 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 PAU15YIR041W 375 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 PHO86YJL117W 936 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 AFT2YPL202C 1251 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MBA1YBR185C 837 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MEF1YLR069C 2286 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 POL4YCR014C 1749 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 PAL1YDR348C 1500 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MPH2YDL247W 1830 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YDL012CYDL012C 324 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YFL032WYFL032W 321 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YGL152CYGL152C 678 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 PUP2YGR253C 783 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YIR042CYIR042C 711 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YJL015CYJL015C 285 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YNL150WYNL150W 408 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YNL184CYNL184C 327 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 YPR099CYPR099C 357 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 ERG4YGL012W 1422 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 ANR2YKL047W 1551 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 GNT1YOR320C 1476 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1A-NL2Q12470 MHP1YJL042W 4197 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 HED1YDR014W-A 489 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-NL2Q12470 YIP4YGL198W 708 nt5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms