Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 snR44snR44 211 nt3.9□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YPL109CYPL109C 1974 nt3.9□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SWH1YAR042W 3567 nt3.9□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SUP45YBR143C 1314 nt3.9□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ACK1YDL203C 1872 nt3.9□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 GCD1YOR260W 1737 nt3.9□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 NTH1YDR001C 2256 nt3.9□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ALG1YBR110W 1350 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ECM16YMR128W 3804 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 PET130YJL023C 1044 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SAM37YMR060C 984 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 FIG1YBR040W 897 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 HAT1YPL001W 1125 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 BTS1YPL069C 1008 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 AVT7YIL088C 1473 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 PDR12YPL058C 4536 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 EPO1YMR124W 2832 nt3.89□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 AIM21YIR003W 2040 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 TSC13YDL015C 933 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 UBC9YDL064W 474 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 FCF1YDR339C 570 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YGR111WYGR111W 1203 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 RPS4BYHR203C 786 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 MRPL49YJL096W 486 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 RPS4AYJR145C 786 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SSO2YMR183C 888 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 IST1YNL265C 897 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YCL022CYCL022C 516 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 BI3Q0115 1554 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ULP1YPL020C 1866 nt3.88□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 DAP2YHR028C 2457 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 HOM2YDR158W 1098 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 RPL24BYGR148C 468 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SUI2YJR007W 915 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 BAT2YJR148W 1131 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YAL066WYAL066W 309 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 DDP1YOR163W 567 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 FAR8YMR029C 1572 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 PGS1YCL004W 1566 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YNR066CYNR066C 1311 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 HSE1YHL002W 1359 nt3.87□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ORC4YPR162C 1590 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YCR099CYCR099C 468 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 COX4YGL187C 468 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 TDA10YGR205W 873 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SOP4YJL192C 705 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 CMC1YKL137W 336 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 TRI1YMR233W 681 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YNL057WYNL057W 333 nt3.86□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 MNL1YHR204W 2391 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ARO80YDR421W 2853 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 NUG1YER006W 1563 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 FRT2YAL028W 1587 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YCR100CYCR100C 951 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 TMA17YDL110C 453 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 MPS2YGL075C 1164 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YGL188CYGL188C 174 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YJR128WYJR128W 360 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 MET14YKL001C 609 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 AUR1YKL004W 1206 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YPT53YNL093W 663 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 TRM112YNR046W 408 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 HNT3YOR258W 654 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ARO4YBR249C 1113 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YPR148CYPR148C 1308 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ART10YLR392C 1557 nt3.85□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YDR131CYDR131C 1671 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 RPO31YOR116C 4383 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 USA1YML029W 2517 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 ZDS1YMR273C 2748 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 CWH43YCR017C 2862 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SPT3YDR392W 1014 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 RPS25AYGR027C 327 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 AIR1YIL079C 1083 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 AIM22YJL046W 1230 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 GCD14YJL125C 1152 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 FMP41YNL168C 780 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 SLM4YBR077C 489 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 FRM2YCL026C-A 582 nt3.84□□□□□ -1.79
SPE4Q12455 TEL1YBL088C 8364 nt3.84□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 KXD1YGL079W 657 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 YGL230CYGL230C 444 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 NIS1YNL078W 1224 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 YOL106WYOL106W 354 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 TYE7YOR344C 876 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 PRM4YPL156C 855 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 ERV15YBR210W 429 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 KRE29YER038C 1395 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 YGR117CYGR117C 1431 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 CIT1YNR001C 1440 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 SPT6YGR116W 4356 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 DSE1YER124C 1722 nt3.83□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 GCN5YGR252W 1320 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 YFL051CYFL051C 483 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 YFR057WYFR057W 456 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 YGL117WYGL117W 798 nt3.82□□□□□ -1.8
SPE4Q12455 YVH1YIR026C 1095 nt3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.8 ms