Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 SIA1YOR137C 1869 nt4.92□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 GCR2YNL199C 1605 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 YFL051CYFL051C 483 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 MOH1YBL049W 417 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 YNL109WYNL109W 546 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 ATG8YBL078C 354 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 NGL1YOL042W 1092 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 ECM33YBR078W 1290 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 SEC66YBR171W 621 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 HCA4YJL033W 2313 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 BRE2YLR015W 1518 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 ABZ1YNR033W 2364 nt4.91□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 NTH2YBR001C 2343 nt4.9□□□□□ -1.62
LPX1Q12405 FIN1YDR130C 876 nt4.9□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YDR269CYDR269C 324 nt4.9□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 CDC12YHR107C 1224 nt4.9□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 PRX1YBL064C 786 nt4.9□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 CHK1YBR274W 1584 nt4.9□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SST2YLR452C 2097 nt4.9□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SYG1YIL047C 2709 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YCR064CYCR064C 411 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 CDC50YCR094W 1176 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 TSC13YDL015C 933 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 ATG31YDR022C 591 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 AIM7YDR063W 450 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 VMA22YHR060W 546 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YPT35YHR105W 645 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 RPL16AYIL133C 600 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YKL083WYKL083W 615 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 APS1YLR170C 471 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 NMA1YLR328W 1206 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SPG4YMR107W 348 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 ATP11YNL315C 957 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 NRM1YNR009W 750 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YNR021WYNR021W 1215 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YOR248WYOR248W 303 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YPL088WYPL088W 1029 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 VPS17YOR132W 1656 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 CDC40YDR364C 1368 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 PMS1YNL082W 2622 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 BUD27YFL023W 2391 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 MEC3YLR288C 1425 nt4.89□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SEO1YAL067C 1782 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 GDB1YPR184W 4611 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 NMD3YHR170W 1557 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 APN2YBL019W 1563 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SAF1YBR280C 1914 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YOR1YGR281W 4434 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 IZH1YDR492W 951 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 VAB2YEL005C 849 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 LOC1YFR001W 615 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SOH1YGL127C 384 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 MIG2YGL209W 1149 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YIL029CYIL029C 429 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YJL175WYJL175W 513 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YJR037WYJR037W 384 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 TPM1YNL079C 600 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 ZPS1YOL154W 750 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 TRS33YOR115C 807 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 DSS4YPR017C 432 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 PBN1YCL052C 1251 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 FRE3YOR381W 2136 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 GLT1YDL171C 6438 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YMR111CYMR111C 1389 nt4.88□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 MOT2YER068W 1764 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YCL075WYCL075W 441 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 snR9snR9 187 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SLX9YGR081C 633 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YHR125WYHR125W 306 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SDP1YIL113W 630 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SOP4YJL192C 705 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 RPL40BYKR094C 387 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YLR287CYLR287C 1068 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YPR197CYPR197C 564 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 snR41snR41 95 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 ENP2YGR145W 2124 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SSY5YJL156C 2100 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 BUD7YOR299W 2241 nt4.87□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 JJJ1YNL227C 1773 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 snR5snR5 204 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 RPL27BYDR471W 411 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 APA2YDR530C 978 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 RMD6YEL072W 696 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 AML1YGR001C 747 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YAP5YIR018W 738 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 DDP1YOR163W 567 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 PDX3YBR035C 687 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 YOR387CYOR387C 621 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 MET31YPL038W 534 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 AVT5YBL089W 1380 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 RAD53YPL153C 2466 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 TDA3YHR009C 1572 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 CET1YPL228W 1650 nt4.86□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 GRS1YBR121C 2004 nt4.85□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 SWI3YJL176C 2478 nt4.85□□□□□ -1.63
LPX1Q12405 EIS1YMR031C 2532 nt4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms