Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YKT6YKL196C 603 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YLR444CYLR444C 303 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YOL024WYOL024W 519 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 UAF30YOR295W 687 nt3.25□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 TSR1YDL060W 2367 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YFL040WYFL040W 1623 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YAL004WYAL004W 648 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 GMH1YKR030W 822 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 REX3YLR107W 1215 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 TVP18YMR071C 504 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 MRPS17YMR188C 714 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 TPM1YNL079C 600 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 CYC2YOR037W 1101 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YBR096WYBR096W 693 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YSA1YBR111C 696 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 RSM23YGL129C 1353 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 ALG1YBR110W 1350 nt3.24□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 ARG5,6YER069W 2592 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 CMK1YFR014C 1341 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 FLO9YAL063C 3969 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 FAP7YDL166C 594 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 TRP4YDR354W 1143 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YFL065CYFL065C 309 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YGR117CYGR117C 1431 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 PET130YJL023C 1044 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YKR015CYKR015C 1707 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 GTT2YLL060C 702 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 BLS1YLR408C 369 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YBL096CYBL096C 309 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 ULP1YPL020C 1866 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 GPI2YPL076W 843 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YBR242WYBR242W 717 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YOL019WYOL019W 1656 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 SMI1YGR229C 1518 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 SHQ1YIL104C 1524 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 CLG1YGL215W 1359 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 STU2YLR045C 2667 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 MSR1YHR091C 1932 nt3.23□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 SQS1YNL224C 2304 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 FUN12YAL035W 3009 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 PST1YDR055W 1335 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 RTT109YLL002W 1311 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 GRX3YDR098C 858 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 SDS3YIL084C 984 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 RPC17YJL011C 486 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YAL069WYAL069W 315 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 NDJ1YOL104C 1059 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 IAH1YOR126C 717 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 PNT1YOR266W 1272 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YPL168WYPL168W 1293 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YBR238CYBR238C 2196 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 SEC6YIL068C 2418 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 AUS1YOR011W 4185 nt3.22□□□□□ -1.89
RRP42Q12277 YDL026WYDL026W 312 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 PSF1YDR013W 627 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 RRP17YDR412W 708 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 ERJ5YFR041C 888 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 MRPL6YHR147C 645 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 TFA2YKR062W 987 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YNL320WYNL320W 855 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 HSH49YOR319W 642 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 NRP1YDL167C 2160 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 SMC3YJL074C 3693 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 APN2YBL019W 1563 nt3.21□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 RPN2YIL075C 2838 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 BAR1YIL015W 1764 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 NAT1YDL040C 2565 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 NUP85YJR042W 2235 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 DNM1YLL001W 2274 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 CTH1YDR151C 978 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 STE14YDR410C 720 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 LDS2YOL047C 1071 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 RPS11BYBR048W 471 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YNR063WYNR063W 1824 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 TPD3YAL016W 1908 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 PGS1YCL004W 1566 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 ETP1YHL010C 1758 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 EXO5YBR163W 1758 nt3.2□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 MTR4YJL050W 3222 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 WBP1YEL002C 1293 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YJR037WYJR037W 384 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 RAD14YMR201C 1116 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 INN1YNL152W 1230 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 MEK1YOR351C 1494 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 HAP4YKL109W 1665 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YAK1YJL141C 2424 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YMR018WYMR018W 1545 nt3.19□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 PMS1YNL082W 2622 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 ACA1YER045C 1470 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 GYP6YJL044C 1377 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 YTA7YGR270W 4140 nt3.18□□□□□ -1.9
RRP42Q12277 ADH4YGL256W 1149 nt3.18□□□□□ -1.9
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