Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 POL31YJR006W 1464 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 IES6YEL044W 501 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YNL171CYNL171C 369 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 CPR8YNR028W 927 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 IZH4YOL101C 939 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 IDH2YOR136W 1110 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 SNF8YPL002C 702 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 AUS1YOR011W 4185 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 VPS53YJL029C 2469 nt3.94□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 RPO21YDL140C 5202 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 AIP1YMR092C 1848 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 MSA1YOR066W 1890 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 ALE1YOR175C 1860 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YDL071CYDL071C 375 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 GLC3YEL011W 2115 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 RSM26YJR101W 801 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 MRP8YKL142W 660 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 MMM1YLL006W 1281 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 ARG80YMR042W 534 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 PLP2YOR281C 861 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 MRP2YPR166C 348 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.93□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 TYS1YGR185C 1185 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 BET1YIL004C 429 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YAR1YPL239W 603 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 NUP85YJR042W 2235 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 PMT6YGR199W 2280 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 SUP45YBR143C 1314 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 PTR3YFR029W 2037 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 ARP4YJL081C 1470 nt3.92□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 UBP10YNL186W 2379 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 ATG26YLR189C 3597 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 SER3YER081W 1410 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 ECO1YFR027W 846 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 TDA3YHR009C 1572 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 CDC12YHR107C 1224 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YLR365WYLR365W 333 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 IBD2YNL164C 1056 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YPL088WYPL088W 1029 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 LDH1YBR204C 1128 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 TGL3YMR313C 1929 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 BAR1YIL015W 1764 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 YRB30YGL164C 1323 nt3.91□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 SPO1YNL012W 1896 nt3.9□□□□□ -1.78
LSP1Q12230 BYE1YKL005C 1785 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SHU2YDR078C 672 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 VFA1YER128W 612 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SEC28YIL076W 891 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YJL028WYJL028W 336 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RPL17AYKL180W 555 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 DCS1YLR270W 1053 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YLR366WYLR366W 306 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YBL062WYBL062W 381 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YNL226WYNL226W 411 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 MCK1YNL307C 1128 nt3.9□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PEX1YKL197C 3132 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RSC1YGR056W 2787 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 FLO9YAL063C 3969 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 FOL2YGR267C 732 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PIR3YKL163W 978 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YAL064WYAL064W 285 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 NAM2YLR382C 2685 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SYT1YPR095C 3681 nt3.89□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 MET10YFR030W 3108 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PSF1YDR013W 627 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PLP1YDR183W 693 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SPT3YDR392W 1014 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 GEP7YGL057C 864 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SDS3YIL084C 984 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 POL32YJR043C 1053 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YNL320WYNL320W 855 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YOR114WYOR114W 885 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SLM4YBR077C 489 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RNR1YER070W 2667 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 SUC2YIL162W 1599 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 JEN1YKL217W 1851 nt3.88□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 VTC4YJL012C 2166 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YKR015CYKR015C 1707 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 TFB2YPL122C 1542 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YCL076WYCL076W 744 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 USE1YGL098W 738 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 GSP1YLR293C 660 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YLR428CYLR428C 345 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RIF2YLR453C 1188 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 MRPS17YMR188C 714 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RUF21RUF21 707 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RRG9YNL213C 645 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 PNO1YOR145C 825 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 TAF3YPL011C 1062 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 MRH4YGL064C 1686 nt3.87□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YDL176WYDL176W 2127 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 YMR018WYMR018W 1545 nt3.86□□□□□ -1.79
LSP1Q12230 RDI1YDL135C 609 nt3.86□□□□□ -1.79
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