Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SYCNQ0VAF6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SYCNQ0VAF6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms