Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RIPPLY1Q0D2K3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RIPPLY1Q0D2K3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms