Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms