Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNA1Q09470 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNA1Q09470 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms