Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RBBP4Q09028 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBBP4Q09028 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms