Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD47Q08722 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD47Q08722 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD47Q08722 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD47Q08722 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD47Q08722 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms