Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4DQ08499 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4DQ08499 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms