Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LOXL1Q08397 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXL1Q08397 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms