Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK18Q07002 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms