Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RELAQ04206 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RELAQ04206 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RELAQ04206 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RELAQ04206 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RELAQ04206 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RELAQ04206 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RELAQ04206 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RELAQ04206 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RELAQ04206 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RELAQ04206 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RELAQ04206 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RELAQ04206 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RELAQ04206 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms