Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPCQ03188 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPCQ03188 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms