Protein–RNA interactions for Protein: Q02979

GDE1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDE1Q02979 YBR096WYBR096W 693 nt5.14□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 PWR1PWR1 941 nt5.14□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 snR37snR37 386 nt5.14□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YEH2YLR020C 1617 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 AXL2YIL140W 2472 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 CTR86YCR054C 1692 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 DTD1YDL219W 453 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 NKP1YDR383C 717 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 SAE3YHR079C-A 276 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 CAP1YKL007W 807 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 MCM16YPR046W 546 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 POL30YBR088C 777 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 KRE6YPR159W 2163 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 CUE3YGL110C 1875 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 PHO5YBR093C 1404 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 PDR15YDR406W 4590 nt5.13□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 AKL1YBR059C 3327 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 ARG82YDR173C 1068 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 KEI1YDR367W 666 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YDR491CYDR491C 492 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 BUD25YER014C-A 462 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YER076CYER076C 909 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 SPR6YER115C 576 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 ERJ5YFR041C 888 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 COA3YJL062W-A 258 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 BNA1YJR025C 534 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 MBR1YKL093W 1020 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YMR187CYMR187C 1296 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 CRT10YOL063C 2874 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 CDC15YAR019C 2925 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 NMD3YHR170W 1557 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 BUD6YLR319C 2367 nt5.12□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 GCD2YGR083C 1956 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 HMO1YDR174W 741 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 BSC2YDR275W 708 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 STE18YJR086W 333 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 SFT1YKL006C-A 294 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 RLP24YLR009W 600 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 GIM3YNL153C 390 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 BRX1YOL077C 876 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 RGS2YOR107W 930 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 ECM23YPL021W 564 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 SUR1YPL057C 1149 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YCL020WYCL020W 1317 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 PRS5YOL061W 1491 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 PUT2YHR037W 1728 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 SSB1YDL229W 1842 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 TPD3YAL016W 1908 nt5.11□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 RIM1YCR028C-A 408 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 RPN6YDL097C 1305 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 HNT2YDR305C 654 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 LIN1YHR156C 1023 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 ERG9YHR190W 1335 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 MPS3YJL019W 2049 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YJL175WYJL175W 513 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 GAD1YMR250W 1758 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YOL029CYOL029C 606 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 PSF3YOL146W 585 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 GRX7YBR014C 612 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 HPA2YPR193C 471 nt5.1□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 AGE1YDR524C 1449 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 TIF4632YGL049C 2745 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 PHO13YDL236W 939 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YHR180WYHR180W 492 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 YIL082WYIL082W 873 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 BUD19YJL188C 309 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 UBI4YLL039C 1146 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 TUM1YOR251C 915 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 CTP1YBR291C 900 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 MSC2YDR205W 2175 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 HOT1YMR172W 2160 nt5.09□□□□□ -1.59
GDE1Q02979 GEM1YAL048C 1989 nt5.09□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 MSS4YDR208W 2340 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 SNO3YFL060C 669 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 YGR026WYGR026W 837 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 YJR141WYJR141W 1044 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 SNO2YNL334C 669 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 RPS11BYBR048W 471 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 SIP1YDR422C 2448 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 CTM1YHR109W 1758 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 MDR1YGR100W 2853 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 TRM44YPL030W 1704 nt5.08□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 PRP11YDL043C 801 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 NGG1YDR176W 2109 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 RSM18YER050C 417 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 YFL068WYFL068W 483 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 LYS5YGL154C 819 nt5.07□□□□□ -1.6
GDE1Q02979 COX18YGR062C 951 nt5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms