Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNT1Q02742 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNT1Q02742 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms